Abv-pb March 2014

abv-pb@list.uva.nl

14 participants
26 discussions

Kaartje voor Floor
by Geerling, Janine 01 Apr '14

01 Apr '14

Hi allemaal. Ik heb zojuist een kaartje gekocht voor Floor, Rogier, Fabian en Pepijn. Vrijdag neem ik hem mee naar SP zodat jullie hem kunnen tekenen. Groetjes, Janine ________________________________ Universiteit van Amsterdam College of Science Dr. J.J. (Janine) Geerling Docent Academische Basisvaardigheden Science Park 904 Werkplek: C2.159a Postvak: C2.161 T: 020-5257624 Werkdagen: di | wo | do | vr ________________________________

1 1

nog een third opinion gevraagd
by Gosselt, Karlijn 28 Mar '14

28 Mar '14

Beste collega's, Ik heb nog een verslag waarvan ik graag wil dat er een derde persoon naar kan kijken. Nienke kijkt ernaar, omdat zij zijn vorige docent was, maar het zou fijn zijn als er een onafhankelijk iemand naar kan kijken. Het zou fijn zijn als het morgen vóór 12:00 uur gedaan kan zijn. Alvast bedankt! Groetjes Karlijn. Universiteit van Amsterdam College of Science Karlijn Gosselt Docent Academische Basisvaardigheden Science Park 904, kamer C2.159a Postvak C2.161 T 020 525 7624 werkdagen: wo-do-vr

2 2

third opinion gevraagd
by Gosselt, Karlijn 27 Mar '14

27 Mar '14

Beste collega's, Ik heb een twijfelgeval van een inhaalstudent voor het LV. Christa heeft er inmiddels al naar gekeken, maar het zou fijn zijn als nog iemand het na kan kijken, omdat de concequenties voor de desbetreffende student nogal groot zijn. Alvast hartelijk bedankt! Gr. Karlijn. Universiteit van Amsterdam College of Science Karlijn Gosselt Docent Academische Basisvaardigheden Science Park 904, kamer C2.159a Postvak C2.161 T 020 525 7624 werkdagen: wo-do-vr

2 2

vrijdag bij BMW/BIO vergadering
by Struik, Jerry 26 Mar '14

26 Mar '14

Beste PB-docenten, Als jullie kunnen is het fijn om vrijdag tussen 900 en 9:30 (B1.49c) even aan te schuiven bij de BMW/BIO vergadering. Ik zal dan een update geven over ontwikkelingen bij de LW-opleidingen en dat is voor PB-ers ook fijn om meteen te horen. Groet, Jerry -------------------- Jerry Struik Coördinator Academische Basisvaardigheden Universiteit van Amsterdam, Biologie, Bio-medische wetenschappen en Psychobiologie, B: Science Park 904, 1098 XH, Amsterdam, kamer C2.158 P: Postbus 94215, 1090 GE Amsterdam T: 020 525 7736 De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht ontvangt, wordt u vriendelijk verzocht de inhoud niet te gebruiken, de afzender direct te informeren dat het bericht niet naar de beoogde ontvanger is gestuurd, en de e-mail te wissen van de eigen computer.

1 0

studentevaluatie in zelfbediening
by Struik, Jerry 26 Mar '14

26 Mar '14

Hoi allemaal, Als het goed is staan de resultaten van de studentevaluatie van semester 1 in jullie zelfbediening (tabje linksboven). Zou je de punten die over jou als docent gaan willen bekijken? Bij het jaargesprek zullen we er op terugkomen. Groet, Jerry -------------------- Jerry Struik Coördinator Academische Basisvaardigheden De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht ontvangt, wordt u vriendelijk verzocht de inhoud niet te gebruiken, de afzender direct te informeren dat het bericht niet naar de beoogde ontvanger is gestuurd, en de e-mail te wissen van de eigen computer.

2 2

werkgroepen overnemen? Ziek... :-(
by Harting, Lisette 20 Mar '14

20 Mar '14

Hoi allen, Ik vrees dat de wereld draait en warm en koud tegelijk is en er iemand op mijn hoofd timmert. Ik weet niet of dat morgenochtend minder is. Zou iemand misschien stand-by kunnen staan / mijn werkgroepen willen overnemen voor mijn werkgroepen van 11 uur en 15 uur? Hartelijke groet, Lisette

7 10

Practicum Celbiologie
by Boor, Ilja 19 Mar '14

19 Mar '14

Beste ABV docenten, Zoals jullie weten hebben we last-minute een aantal aanpassingen gemaakt. Ik begrijp dat het vervelend is dat jullie zo kort voor de werkgroepen veranderingen door kregen en wil jullie dan ook graag persoonlijk een korte toelichting geven. De grootste aanpassing is het gebruiken van een fictieve data set. In de onderstaande announcement voor studenten, die ik op BlackBoard heb gezet, ga ik hier kort op in. De belangrijkste reden voor de lage Z-factor is problemen bij het tellen van de cellen. Sommige studenten hadden matige kwaliteit foto's en/of sommige studenten vonden het moeilijk om de verschillen in lokalisatie van het GFP signaal te zien. Er zijn een aantal tafels waarbij de Z-factor wel groter is dan 0,5 (oa beide honoursgroepen), maar de n-waarde is hier te laag om statistiek toe te passen. Morgen (P9-P12 ochtendgroep en P13-P18 middaggroep) en vrijdag (P1-P6) gaan we tijdens het laatste practicum met de studenten in op de eigen dataset en de betekenis van een lage Z-waarde en mogelijke discussiepunten. Daarnaast gaan we de betekenis van de fictieve dataset bespreken. Ik wil het practicum graag positief afsluiten en de studenten meegeven dat negatieve data ook heel waardevol en leerzaam zijn, maar dat we nu gekozen hebben voor een praktische oplossing. Ik wil je bedanken voor je flexibiliteit en inzet en veel succes wensen in de aankomende werkgroep. Mochten er vragen en/of opmerking zijn aarzel niet op me te mailen. Hartelijke groet, Ilja Announcement op BlackBoard op woensdag 19 maart: Beste studenten, Zoals jullie hebben gemerkt hebben we geen robuust assay. Dat is een uitkomst waar jullie prima een discussie en evaluatie over kunnen schrijven in je labjournaal. Voor het schrijven van jullie onderzoeksverslag bij ABV is het een stuk lastiger aangezien jullie dan geen antwoord kunnen geven op het tweede deel van de vraagstelling: 'zo ja, heeft de experimentele conditie effect op de translocatie '. Je kunt vervolgens ook geen grafieken maken, statistiek toepassen en deze data interpreteren en evalueren. Daarom hebben we besloten om gebruik te maken van een fictieve dataset. In de folder 'fictieve dataset' op BlackBoard staat het R-script, een Excel bestand met de data en een document met instructies voor de data analyse. Voor degene die al gewerkt hebben met de eigen dataset: we verwachten dat jullie sneller zijn met de analyse en discussie van de nieuwe fictieve dataset. Daarnaast doen jullie ervaring op met het omgaan met negatieve data en kritisch nadenken over de discussie punten. Iets wat zeer waardevol is voor jullie toekomstige wetenschappelijke carrière. Tenslotte wil ik jullie vragen om alles wat je al in je labjournaal hebt geschreven te laten staan en de nieuwe dataset hieraan toe te voegen. Succes met de analyse, Ilja ________________________________ Dr. Ilja Boor Docent practicum Levenswetenschappen Universiteit van Amsterdam Science Park 904, 1098 XH Amsterdam Kamer: C3.269 Tel: 020 525 5155 E-mail: P.K.I.Boor(a)uva.nl<mailto:P.P.K.I.Boor@uva.nl>

1 0

checklist peer review pb
by Holtman, Linda 19 Mar '14

19 Mar '14

Op de server in de map 'extra en logistiek' van wg 18 staat een checklist voor de peer review van de M&M en resultaten van het OV, voor iedereen die dat handig vindt. Gebruik en verander gerust! :) Zie ook bijlage. Groet, Linda Dr. Linda Holtman Docent Academische Basisvaardigheden - Psychobiologie Universiteit van Amsterdam Science Park - Kamer C3.141 020 - 525 8451 l.holtman(a)uva.nl<mailto:l.holtman@uva.nl>

1 0

Herziene Analyse
by Romeijn, Nico 19 Mar '14

19 Mar '14

Beste allen, Nieuws vanuit de practicumkamer: De studenten zullen vandaag per mail te horen krijgen dat ze met een fictieve dataset aan de slag gaan, omdat de Z-factor van hun eigen dataset te laag was. Daarnaast wordt de analyse herzien: Boris heeft het R-script herschreven. De analyse wordt een ANOVA, waarbij eerst getoetst wordt of het percentage translocatie (# getelde cellen met GFP in kern / # aantal getelde cellen) verschilt tussen negatieve controle, positieve controle, experimentele conditie 1, 2, 3, en 4. Indien er een significant verschil wordt gevonden, wordt vervolgens in post-hoc tests getoetst welke condities significant verschillen van elkaar. Alle studenten gaan zelf het R-script runnen op de fictieve dataset. Deze output zal een figuur zijn met op de Y-as % translocatie, op de de x-as de 6 condities. Tevens krijgen de studenten een output sheet uit R, waarin alle post-hoc tests beschreven zijn. De taak van de studenten is het interpreteren van de data, en het interpreteren van de post-hoc tests. Studenten zullen op weg worden geholpen met interpreteren van de post-hocs d.m.v. vragen in een hulpdocument, dat op blackboard geupload zal worden. Om de discussie van het OV verder te helpen, gaan in dagdeel 12 van het practicum (morgen en vrijdag) studenten voor hun eigen experimentele conditie een plotje maken, waarin % GFP-cellen in drie "gebieden" naast elkaar geplot worden: kern, cytoplasma en partieel. Deze plot wordt verder niet getoetst, maar zou studenten met condities voor partiele translocatie een kans kunnen geven op een verklaring waarom de translocatie naar de kern laag is (de 2 verklaringen zijn omdat het uberhaupt niet kan, hetgeen zou resulteren in een lage partiele staafdiagram, en een hoge cytoplasmadiagram, of omdat translocatie wel kan maar minder efficient verloopt, waardoor de partiele staaf hoog en de cytoplasmastaaf laag is). Boris heeft op dit moment het script af. We tweaken nog de laatste paar punten in de data, en dan zullen de studenten gemaild worden. Groeten, Nico Dr. N. Romeijn Docent Academische Basisvaardigheden - Psychobiologie College of Science Universiteit van Amsterdam Science Park 904 Werkplek: C2.159a Postvak: C2.161 T: 020 525 7624 Werkdagen: wo|do|vr

1 0

Notulen 19-03
by Romeijn, Nico 19 Mar '14

19 Mar '14

Beste allen, hierbij de notulen van onze meeting van 19-03. Excuses voor de misschien onoverzichtelijke notatie. De notulen staan inmiddels ook op de netwerkschijf. Groeten, Nico Dr. N. Romeijn Docent Academische Basisvaardigheden - Psychobiologie College of Science Universiteit van Amsterdam Science Park 904 Werkplek: C2.159a Postvak: C2.161 T: 020 525 7624 Werkdagen: wo|do|vr

1 0

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

Abv-pb March 2014