Abv-pb March 2015

abv-pb@list.uva.nl

8 participants
30 discussions

Werkgroep 18
by Giesbertz, Brit 19 Mar '15

19 Mar '15

Hoi, Heb zonet mijn werkgroep gegeven, en de uitleg ging eigenlijk heel goed. Heb mijn powerpoint net op de server gezet met wat slides over de interpretatie van een negatieve Z-factor. Als jullie nog suggesties daarvoor hebben, let me know, moet morgen we werkgroep weer 2x geven. FYI: Ben nog tot 12:30 op Science Park want mijn zus gaat promoveren vanmiddag. Grts, Brit

1 0

Z-factor en t-tests
by Romeijn, Nico 19 Mar '15

19 Mar '15

Beste allen, Omdat ik zojuist nog even in het F-gebouw moest zijn, ben ik ook nog even naar de practicumzalen gelopen om Linda en Boris de consensus mee te delen die we bereikt hebben in de vergadering. Kort samengevat, zijn we binnen ABV overeengekomen dat een test met een robuuste Z-factor de onderzoeker in staat stelt om met enkel de meting van een ligand te bepalen of deze ligand tot de categorie agonsiten of antagonisten behoord. Indien we geen robuuste Z-factor hebben, is deze categorisatie te bepalen indien we de ligand en controleconditie meerdere keren meten en het verschil hiertussen toetsen d.m.v. een t-test (of post-hoc na een ANOVA, in geval meerdere liganden). Boris en Linda zijn het eens met deze interpretatie. Ze willen wel de kanttekening maken dat we binnen ABV niet moeten stellen dat beide manieren "dubbelop" zijn, omdat ze statistisch van elkaar verschillen. Ze zijn het echter wel eens dat beide manieren de onderzoeker in staat stellen om een ligand te klassificeren als zijnde wel of niet anders dan een controleconditie, en in zoverre dus het wel hetzelfde biologische doel dienen. Daarnaast willen ze opmerken dat het zeer waarschijnlijk ook bij het testen van een nieuwe ligand in een test met een robuuste Z-factor nodig is om je nieuwe ligand meerdere keren te meten. Het door ons te communiceren grootste voordeel van een test met een robuuste Z-factor, werd door Boris beaamd: Bij onderzoeken waarin je een nieuwe ligand wilt testen, is het voordeel van een robuuste test dat je niet weer opnieuw de controlecondities mee hoeft te testen. Indien je het verschil met t-tests wilt bepalen, zul je voor iedere nieuwe ligand meerdere metingen moeten doen van ligand EN controle (met alle vals-positieve problemen van meerdere testen als gevolg). Laat het me vooral weten indien dit geen goede samenvatting is van ons gesprek, Linda en Boris! Groeten, Nico Dr. N. Romeijn Docent Academische Basisvaardigheden / Coördinator Slaap-Waakonderzoek - Psychobiologie College of Science Universiteit van Amsterdam Science Park 904 Werkplek: C2.159a Postvak: C2.161 T: 020 525 7624 Werkdagen: wo|do|vr

3 2

Notulen 18-03-2015
by Giesbertz, Brit 18 Mar '15

18 Mar '15

De notulen, uiteraard niet Nico's mail erin meegenomen..

1 0

agenda morgen
by Struik, Jerry 17 Mar '15

17 Mar '15

Hoi allemaal, Hierbij de agenda voor morgen. Groetjes Jerry Vergadering woensdag 18 maart 2015 (week 12) B1.49A Notulist: Brit 13.00-13.05 Notulen en actielijst 13.05-13.15 Mededelingen en ingekomen stukken 13.15-13.50 Voorbespreking WG 18 13.50-14.00 Pauze 14.00-14.10 WVTTK 14.10-14.20 Rondvraag 14.20-14.50 Collen (Collega Ondersteunend Leren) deel I en deel II * Wie selecteert OV voor de kalibratie volgende vergadering? Groet, Jerry -------------------- Jerry Struik Coördinator Academische Vaardigheden Universiteit van Amsterdam, Psychobiologie, B: Science Park 904, 1098 XH, Amsterdam, kamer C2.158 P: Postbus 94215, 1090 GE Amsterdam T: 020 525 7736 De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht ontvangt, wordt u vriendelijk verzocht de inhoud niet te gebruiken, de afzender direct te informeren dat het bericht niet naar de beoogde ontvanger is gestuurd, en de e-mail te wissen van de eigen computer.

1 0

informatie studenten die geen practicum doen
by Remmers, Elisa 17 Mar '15

17 Mar '15

Hoi allemaal, n.a.v. de vraag van Lisette even een update over hoe het werkt voor studenten die geen practicum doen: Alle informatie zie ze nodig hebben staat/komt op de blackboard van Celbiologie. Het R script staat nu op de BB site van Celbiologie en in de handleiding staat een begeleidende tekst. De data komen ook op de blackboard van Celbiologie. Daar zouden ze in principe mee uit de voeten moeten kunnen. Geef even aan mij door of je studenten hebt in je groep waar dit voor geldt (dan zorg ik dat ze worden toegevoegd aan de blackboard Celbiologie, voor zover dat nog niet zo is), Graag naam en studentnummer doorgeven. Als de studenten willen mogen ze ook aanschuiven bij het data-analysegedeelte in het practicum, dat is vanmiddag of morgenmiddag. De studenten moeten dan even een mailtje sturen dat ze komen naar de eerstejaars psychobiologie mail. Als je denkt dat jouw student daar behoefte aan heeft, mail die student dan zelf even om dit aan te geven. Groeten, Elisa ------------------------------------------------------------------------ Elisa Remmers, MSc Docent Academische Basisvaardigheden Universiteit van Amsterdam Faculteit Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica Postbus 94215 | 1090 GE Amsterdam Science Park 904, kamer C3.141, postvak C2.161 020-525 5184 (020-525 7624) Aanwezig op di, wo, do, vr

2 1

data voor mensen die het practicum niet doen
by Harting, Lisette 13 Mar '15

13 Mar '15

Hoi allen, Hoe zat het ook alweer? Krijgen de mensen die geen practicum doen de data van ons via Blackboard met een R-scriptje? Ik heb even niet opgelet en kreeg er vragen over. Hartelijke groet, Lisette

1 0

FW: gekraakte vergaderzaaltje
by Struik, Jerry 13 Mar '15

13 Mar '15

Hoi allen, Het vergaderzaaltje bij ons in de gang is weer 'normaal' in gebruik. Als je daar een reservering op had moet je dus iets vervangends zoeken. Groetjes Jerry From: Kessels, Joëlle [mailto:J.G.H.Kessels@uva.nl] Sent: donderdag 12 maart 2015 14:12 To: cos-avcoordinatie(a)list.uva.nl Subject: [AV] gekraakte vergaderzaaltje Dag allen, Misschien heb je het al gezien, maar het vergaderzaaltje in onze gang waar we tijdelijk gebruik van mochten maken van Kick is nu weer bewoond. We kunnen hier dus geen gebruik meer van maken. Groet! Joëlle ---------------------------------------------- Drs. Joëlle Kessels Coördinator Academische Basisvaardigheden en Tutoraat Bachelor Natuur- en Sterrenkunde Sciencepark 904, kamer: C2.157 Telnr: 020-5258628 Postadres: postbusnummer 94214, 1090 GE Amsterdam

1 0

Blackboard-oeps!
by Harting, Lisette 12 Mar '15

12 Mar '15

Als iemand zich afvroeg waarom z/hij nou alweer die stomme Blackboard mededeling kreeg: ik ben weer in de bug van Blackboard gestonken... Zodra je de status van een bericht op 'onzichtbaar' zet, stuurt hij hem _weer_ rond. Argh! Ik was het even vergeten. Nu niet meer. Sorry! Dan weet je waar het gemopper van je studenten vandaan komt... Hartelijke groet, Lisette

1 0

Julia ziek
by Struik, Jerry 12 Mar '15

12 Mar '15

Hoi allen, Kan er iemand standby staan voor het geval Julia morgen haar werkgroep niet kan geven? Groetjes Jerry From: Sassi, Julia Sent: donderdag 12 maart 2015 10:56 To: Struik, Jerry Subject: RE: Ik ben vandaag thuis. Hoi Jerry, Ik ben vandaag ook thuis vanwege de griep. Ik denk dat ik morgen de werkgroep gewoon ga geven maar voor het geval ik het morgen toch niet zie zitten is het misschien goed om iemand als stand by te hebben? Groet, Julia From: Struik, Jerry [mailto:J.Struik@uva.nl] Sent: donderdag 12 maart 2015 10:00 To: Abv-pb(a)list.uva.nl<mailto:Abv-pb@list.uva.nl> Subject: [Abv-pb] Ik ben vandaag thuis. Hoi allen, Max is ziek, ik blijf vandaag thuis. Ik ben mobiel bereikbaar en check af en toe mail. Groet, Jerry -------------------- Jerry Struik Coördinator Academische Vaardigheden Universiteit van Amsterdam, Psychobiologie, B: Science Park 904, 1098 XH, Amsterdam, kamer C2.158 P: Postbus 94215, 1090 GE Amsterdam T: 020 525 7736 De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht ontvangt, wordt u vriendelijk verzocht de inhoud niet te gebruiken, de afzender direct te informeren dat het bericht niet naar de beoogde ontvanger is gestuurd, en de e-mail te wissen van de eigen computer.

2 1

SVT
by Laan, Janneke van der 12 Mar '15

12 Mar '15

Dag allen, ben ik weer. Wat betreft de studievaardigheden: er zijn nu 7 aanmeldingen na de deadline. Dit betekent dat er nog ruimte is voor 3 á 6 personen, het is prima als ze zich nog vandaag of morgen aanmelden (eind van de dag morgen ga ik spullen klaarleggen/printen dus dan moet ik wel een indicatie van de groepsgrootte hebben). Bij deze dus nog even de reminder: zouden jullie de studenten waarvan jullie denken dat ze de SVT kunnen gebruiken nog even willen aanmoedigen om zich aan te melden? Ik hou het wel het liefst bij de groep die C advies of lager hebben gekregen (dus de studenten die een uitnodiging hebben ontvangen), zodat ik beter op deze studenten in kan spelen tijdens de training. Mocht je onzeker zijn over of een student wel is uitgenodigd, laat het me even weten, ik heb een lijst met alle studenten die zijn uitgenodigd. Groetjes, Janneke -------------------------------------------------------- Janneke E. van der Laan Docent Academische Basisvaardigheden Psychobiologie E-mail: J.E.vanderlaan(a)uva.nl Tel: 020 525 7883 Kamer: C2.159a Aanwezig: wo-do-vrij Universiteit van Amsterdam College of Science Science Park 904 1098 XH Amsterdam

1 0

2024

2023

2022

2021

2020

2019

2018

2017

2016

2015

2014

2013

2012

2011

Abv-pb March 2015