Beste allen,
Wat betreft de leesvaardigheid artikelen zou ik nog uitzoeken wat tract-based spatial statistics (TBSS) is. Hieronder mijn samenvatting 😉 Vul of pas gerust aan als je denkt dat ik iets mis…
Probleem: In het artikel van Walton et al (2018) worden twee technieken gebruikt: TBSS en tractografie. We kwamen er zelf niet goed uit wat er precies wordt verstaan onder die twee technieken. Vooral TBSS was ingewikkeld voor ons.
Oplossing: In het artikel van Smith et al. (2006) wordt TBSS uitgelegd. Het is nog steeds vrij ingewikkeld, maar ik denk dat de volgende uitleg aan studenten voldoet: TBSS: In de witte stof van het brein worden watermoleculen omgeven door myeline. Deze neuronen vormen dus een soort buisjes waar water in zit. Met DTI kun je per voxel (=3D pixel) nagaan in hoeverre er een richting bestaat waarin de watermoleculen ten opzichte van elkaar gerangschikt zijn (fractional anisotropy (FA) is een maat voor die gerichtheid). Hierin nemen we aan: hoe sterker deze richting aanwezig is, hoe sterker de witte stof baan in die voxel. Om proefpersonen te vergelijken moet er gecorrigeerd worden voor anatomische verschillen tussen proefpersonen. TBSS is een methode om dat te doen. Hierbij worden de data van individuele proefpersonen geprojecteerd op een standaard sjabloon (dwz template) van een brein. Vervolgens kan bijv voxel voor voxel bekeken worden hoe de FA gecorreleerd is met het niveau van leesvaardigheid. Tractografie: is een analyse die vaak volgt op TBSS en is bedoeld om zenuwbanen in kaart te brengen. Hierbij wordt de zenuwbaan ‘gevolgd’ op basis van FA waarden per voxel.
Literatuur: Voor het Smith et al (2006) artikel zie map: X:\Onderwijs\PB Docenten\1920 ABV\1920 Werkgroepen ABV 1.1\documenten LV\Artikelen leesvaardigheid\Achtergrond informatie.
Met vriendelijke groet, Joost
Ha bedankt Joost voor deze heldere uitleg.
Ik had toevallig ook nog wat slides uit mijn Master over fiber tracking eruit gezocht en nu ook op de server gezet: P:\Onderwijs\PB Docenten\1920 ABV\1920 Werkgroepen ABV 1.1\documenten LV\Uitleg en toelichting
Groetjes,
Mao
________________________________ Van: Kordelaar, Joost van j.vankordelaar@uva.nl Verzonden: donderdag 24 oktober 2019 14:34:33 Aan: abv-pb (Abv-pb@list.uva.nl) Onderwerp: [Abv-pb] TBSS en tractography
Beste allen,
Wat betreft de leesvaardigheid artikelen zou ik nog uitzoeken wat tract-based spatial statistics (TBSS) is. Hieronder mijn samenvatting 😉 Vul of pas gerust aan als je denkt dat ik iets mis…
Probleem: In het artikel van Walton et al (2018) worden twee technieken gebruikt: TBSS en tractografie. We kwamen er zelf niet goed uit wat er precies wordt verstaan onder die twee technieken. Vooral TBSS was ingewikkeld voor ons.
Oplossing: In het artikel van Smith et al. (2006) wordt TBSS uitgelegd. Het is nog steeds vrij ingewikkeld, maar ik denk dat de volgende uitleg aan studenten voldoet: TBSS: In de witte stof van het brein worden watermoleculen omgeven door myeline. Deze neuronen vormen dus een soort buisjes waar water in zit. Met DTI kun je per voxel (=3D pixel) nagaan in hoeverre er een richting bestaat waarin de watermoleculen ten opzichte van elkaar gerangschikt zijn (fractional anisotropy (FA) is een maat voor die gerichtheid). Hierin nemen we aan: hoe sterker deze richting aanwezig is, hoe sterker de witte stof baan in die voxel. Om proefpersonen te vergelijken moet er gecorrigeerd worden voor anatomische verschillen tussen proefpersonen. TBSS is een methode om dat te doen. Hierbij worden de data van individuele proefpersonen geprojecteerd op een standaard sjabloon (dwz template) van een brein. Vervolgens kan bijv voxel voor voxel bekeken worden hoe de FA gecorreleerd is met het niveau van leesvaardigheid. Tractografie: is een analyse die vaak volgt op TBSS en is bedoeld om zenuwbanen in kaart te brengen. Hierbij wordt de zenuwbaan ‘gevolgd’ op basis van FA waarden per voxel.
Literatuur: Voor het Smith et al (2006) artikel zie map: X:\Onderwijs\PB Docenten\1920 ABV\1920 Werkgroepen ABV 1.1\documenten LV\Artikelen leesvaardigheid\Achtergrond informatie.
Met vriendelijke groet, Joost
-
Hashemi, Mao -
Kordelaar, Joost van